Наповнивши акваріум водою і посадивши рослини, через два-три дні власник зауважує, що вода каламутніє. Це відбувається через розвиток величезної кількості бактерій. Через пару днів вони загинуть, оскільки «з’їдять» всі поживні речовини, що знаходяться в воді, і акваріум стане кристально чистим.Такий процес називається встановленням початкового біологічного режиму.

При оптимальному біологічному режимі вода абсолютно прозора і має ледве вловимий запах свіжоскошеної трави або водоростей.Догляд за акваріумом спрямований на підтримку цього стану і полягає в правильному годуванні мешканців, періодичного чищення водойми і регулярної підміні води. Мінімальна підміна води, приблизно 25% обсягу в місяць, необхідна навіть при найдосконаліших системах фільтрації і стерилізації.Під час акліматизації риби потребують більш часту підміну води (щотижня або навіть щоденно) і у великих обсягах – до 90%.

Звичайно, воду треба спеціально підготувати, тобто в першу чергу звільнити від хлору. Її температура і показник рН повинні бути такими ж, як в акваріумі.Обростання стінок акваріума зеленими водоростями зазвичай вказує на сприятливий режим, і з цього приводу власникові не варто турбуватися. Скло очищають лезом бритви. Для оргскла більше підходить груба капронова тканина, яка не дряпає пластик.Магнітні очисники з пластмасовою щіткою придатні для акваріумів обох типів.

Залишки водоростей, екскременти риб і равликів прибирають з дна, висмоктуючи їх разом з водою гумовим або пластиковим шлангом.Потім, щоб довести рівень рідини до норми доливають звичайну водопровідну воду (але не більше 5-10% за раз). При генеральному прибиранні, коли відсмоктується об’єм занадто великий, для очищення водопровідної води застосовують препарати типу «Хлор-мінус» або попередньо відстоюють її.