При порушенні біологічної рівноваги можливо бурхливе розмноження будь-якого виду водоростей. Синьо-зелені водорості утворюють колонії різного кольору – від яскраво-зеленої до синюватою і буро-зеленої. Особливістю всіх синьо-зелених водоростей є виділення рясної слизу.Ці водорості починають розмножуватися при сильному освітленні на поверхні фільтруючих матеріалів у зовнішніх фільтрах, в тих місцях, де вони, перебуваючи у водному середовищі, мають найбільший контакт з повітрям.

Синьо-зелені водорості чудово витягують з навколишнього середовища всі необхідні елементи, і зокрема азот. Вони самостійно синтезують всі речовини, необхідні для їх розвитку.Синьо-зелені водорості з’являються і починають бурхливо розмножуватися в інтенсивно аерованих акваріумах або при наявності у воді надлишкової кількості органічних сполук.

Існують різні способи боротьби з ними.Для цього краще за все підібрати оптимальний режим утримання акваріума, зменшити яскравість освітлення, обмежити аерацію. Дуже корисно пустити на поверхню води більше плаваючих рослин. Підміну води проводити не слід. У таких умовах водорості гинуть через 2-3 тижні.

Швидкого успіху в боротьбі з водоростями можна досягти за допомогою антибіотиків і різних барвників.